למשל, תופעות לוואי הקשורות בטיפול התרופתי כמו ליפודיסטרופיה, נאורופתיה פריפרית ודיכאון הן תופעות העשויות לשבש את איכות החיים במידה ניכרת ולגרום לירידה של ממש בתפקוד. פגיעה במערכת העצבים המרכזית נצפית אף היא בכל שלבי הנשאות והמחלה, אם כי ביטוייה עשויים להשתנות עם התקדמות המחלה: בשלבים הראשונים עשויה להיות רק פגיעה קלה בריכוז ובזיכרון, ואילו בשלבים מאוחרים עשוי להתפתח שיטיון של ממש.

למרות כל האמור לעיל עדיין כרבע מהחולים סובלים מסיבוכים של מחלות סופניות הקשורות בדיכוי חיסוני כמו גידולים ממאירים, PLM, ותסמונת הדלדול. בשלבי מחלה אלו הטיפול התומך הוא כמו הטיפול התומך הקלאסי בחולים אונקולוגיים.

הטיפול התומך באיידס כולל טיפול ספציפי נגד הנגיף בתרופות היעילות נגד נגיף עמיד, טיפול ספציפי בזיהומים ובגידולים האופורטוניסטיים, טיפול בסבוכים המטבוליים ונוירופתיה הפריפרית, מניעת תופעות לוואי של תרופות, תמיכה סוציאלית ופסיכולוגית, וטיפול בסוגיות סופניות בשלבי המחלה המתקדמים, כאשר החולה לוקה בגידול או זיהום סופניים.